เรื่องราวในภาคนี้ต่อเนื่องจากเหตุการณ์ในภาคแรก โดยมีตัวละครหลักอย่าง Kenji Endo (รับบทโดย Toshiaki Karasawa) และเพื่อน ๆ ที่ต้องเผชิญกับภัยคุกคามจาก “Friend” ผู้ที่พยายามสร้างโลกใหม่ตามแนวคิดของเขาเองและมีแผนการที่จะทำลายล้างโลกด้วยอาวุธชีวภาพ
หลังจากที่กลุ่มของ Kenji ต้องการหยุดยั้งแผนการชั่วร้ายของ Friend พวกเขาต้องทำงานร่วมกันอีกครั้งเพื่อเปิดเผยความจริงและหยุดการทำลายล้างที่ Friend ตั้งใจจะทำ
ในขณะเดียวกันมีการเปิดเผยความลับเกี่ยวกับอดีตของ Kenji และการมีส่วนร่วมของเขาในแผนการที่ซับซ้อน ทำให้ความสัมพันธ์ระหว่างตัวละครต้องเผชิญกับการทดสอบและอุปสรรค