หลังจากที่กลุ่ม Guardians of the Galaxy ประสบความสำเร็จในการช่วยจักรวาล พวกเขายังคงเดินทางผจญภัยและทำงานเป็นทีมเพื่อปกป้องโลก ในภาคนี้ เรื่องราวมุ่งเน้นไปที่ความสัมพันธ์ในครอบครัว โดยเฉพาะความสัมพันธ์ระหว่าง Peter Quill (รับบทโดย Chris Pratt) และ Ego (รับบทโดย Kurt Russell), พ่อของเขาที่เปิดเผยตัวตนของเขาและความสามารถที่น่าทึ่ง
ขณะเดียวกัน กลุ่ม Guardians ต้องเผชิญหน้ากับภัยคุกคามใหม่และการตามล่าจาก Ayesha, ผู้นำของ Sovereign ที่ต้องการล้างแค้นหลังจากที่ Guardians ช่วยเหลือเธอจากการถูกทำลาย
การเดินทางของพวกเขาจะพาไปสู่การค้นหาตัวตน ความหมายของครอบครัว และการเผชิญหน้ากับอดีตที่กลับมาหลอกหลอน