เรื่องราวติดตาม Hellboy, ปีศาจที่ถูกเรียกมาจากนรกเพื่อทำงานในหน่วยงานที่ดูแลเรื่องสิ่งเหนือธรรมชาติ B.P.R.D. (Bureau for Paranormal Research and Defense) ซึ่งเขาต่อสู้กับพวกอาชญากรและสิ่งมีชีวิตที่มีพลังเหนือธรรมชาติ
ในครั้งนี้, Hellboy ต้องเผชิญหน้ากับ Vivian Nimue (รับบทโดย Milla Jovovich), แม่มดที่มีแผนการที่จะทำลายมนุษยชาติและปลุกเหล่าพวกปีศาจขึ้นมา Hellboy ต้องต่อสู้ไม่เพียงแค่กับศัตรูที่มีพลัง แต่ยังต้องต่อสู้กับความมืดในตัวเขาเอง และค้นหาความหมายของการเป็นฮีโร่ในโลกที่ไม่เข้าใจเขา
