ในภาคนี้ Mumble (ให้เสียงโดย Elijah Wood) กลับมาอีกครั้งพร้อมกับลูกชายของเขา Erik (ให้เสียงโดย Ava Acres) ที่ไม่แน่ใจในความสามารถของตนเอง Erik รู้สึกอายที่ไม่ได้เต้นรำเหมือนกับเพนกวินตัวอื่น ๆ และต้องการค้นหาตัวตนของเขา
เมื่อโลกของเพนกวินต้องเผชิญกับภัยคุกคามจากการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศและการสูญเสียที่อยู่อาศัย Mumble และ Erik ต้องร่วมมือกันเพื่อช่วยเพื่อนฝูงและครอบครัว พวกเขาได้พบกับ Benny (ให้เสียงโดย Brendan Gleeson), เพนกวินที่มีความสามารถพิเศษในการเต้นรำและช่วยให้ Erik ค้นพบความมั่นใจในตัวเอง
ในขณะเดียวกัน Gloria (ให้เสียงโดย Pink) ภรรยาของ Mumble ก็มีบทบาทสำคัญในการช่วยเหลือและสนับสนุนครอบครัวให้ผ่านพ้นปัญหาต่าง ๆ
