เรื่องราวเริ่มต้นเมื่อ Naruto Uzumaki (นารูโตะ อุซึมากิ) ถูกจับกุมในข้อหาฆาตกรรมที่เขาไม่ได้ก่อขึ้น โดยที่เขาถูกกล่าวหาว่าเป็นคนที่ทำให้ Mister Kazan (เจ้าหน้าที่ผู้มีอำนาจ) ตาย ในขณะที่เขาไม่ได้มีส่วนเกี่ยวข้องกับเหตุการณ์นี้
Naruto ถูกส่งไปยัง Hozuki Castle, คุกที่มีชื่อเสียงในการทรมานนักโทษและมีการใช้วิธีการข่มขู่ที่โหดร้าย ในขณะที่เขาพยายามหาวิธีหลบหนีและพิสูจน์ความบริสุทธิ์ของตัวเอง เขาได้พบกับนักโทษคนอื่น ๆ ที่มีพลังพิเศษ และต้องร่วมมือกับพวกเขาในการหาทางหนีจากคุกที่อันตรายนี้