ภาพยนตร์ติดตามการเดินทางของ ไมโล ธาช (Milo Thatch) นักภาษาศาสตร์และนักแผนที่ที่เชื่อว่ามีเมืองแอตแลนติสที่หายสาบสูญอยู่จริง เขาเข้าร่วมกลุ่มนักสำรวจที่มีความหลากหลายเพื่อตามหาเมืองนี้ โดยเมื่อถึงที่นั่น ไมโลและกลุ่มจะต้องเผชิญกับความขัดแย้งระหว่างชาวแอตแลนติสที่ต้องการปกป้องอารยธรรมของตนและนักล่าที่ต้องการใช้ประโยชน์จากทรัพยากรของเมือง
