เรื่องราวเกิดขึ้นในเมือง Gotham City ที่อยู่ในสภาพเสื่อมโทรมเมื่อ Bruce Wayne (เสียงพากย์โดย Peter Weller) ตัดสินใจที่จะกลับมาเป็น Batman หลังจากที่เลิกทำหน้าที่ไปนานถึง 10 ปี ในช่วงเวลาที่เขาหายไป, เมืองเต็มไปด้วยอาชญากรรมและความโกลาหล และตำรวจไม่สามารถควบคุมสถานการณ์ได้
เมื่อเกิดกลุ่มอาชญากรรมใหม่ที่เรียกว่า The Mutants, Batman ต้องหาวิธีในการต่อสู้กับพวกเขาและกลับมาปกป้องเมืองที่เขารัก ในขณะที่เขาต้องเผชิญกับความท้าทายทั้งจากอาชญากรและความสงสัยจากสังคม รวมถึงการเผชิญหน้ากับ Superman (เสียงพากย์โดย Mark Valley) ที่ถูกส่งมาจากรัฐบาลเพื่อหยุดยั้งเขา
