เรื่องราวในภาพยนตร์ติดตาม Batman (เสียงโดย Kevin Conroy) ที่พยายามหยุดยั้ง Joker (เสียงโดย Mark Hamill) ผู้ที่มีแผนการร้ายที่จะทำลายชีวิตของ Barbara Gordon (รับบทโดย Tara Strong) ซึ่งเป็นลูกสาวของ Commissioner Gordon
Joker ใช้ Barbara เป็นเครื่องมือในการทำลาย Batman โดยการจับเธอและสร้างความหวาดกลัวให้กับครอบครัวของเธอ โดยมีเป้าหมายที่จะทำให้ Batman ต้องเผชิญกับความเจ็บปวดและการสูญเสีย
ภาพยนตร์นี้แบ่งออกเป็นสองส่วน ส่วนแรกมุ่งเน้นไปที่ความสัมพันธ์ระหว่าง Batman และ Batgirl และการต่อสู้กับอาชญากรรมในเมือง Gotham ขณะที่ส่วนที่สองจะเจาะลึกเข้าไปในอดีตของ Joker และเหตุผลที่ทำให้เขากลายเป็นวายร้ายที่โหดร้าย
