เรื่องราวในภาคนี้เกิดขึ้นหลายปีหลังจากเหตุการณ์ในภาคแรก โดยเนื้อเรื่องติดตาม Shuuya Nanahara (รับบทโดย Tatsuya Fujiwara) ผู้รอดชีวิตจากภาคแรกที่ตอนนี้กลายเป็นผู้นำกลุ่มผู้ต่อต้านรัฐบาลที่ใช้นโยบายการฆ่าล้างเผ่าพันธุ์เด็กวัยรุ่นในรูปแบบของเกม Battle Royale
รัฐบาลตัดสินใจส่งนักเรียนกลุ่มใหม่ไปยังเกาะเพื่อเข้าร่วมในเกมครั้งใหม่ ซึ่งมีการเปลี่ยนแปลงกฎใหม่ที่มากขึ้นและมีความโหดร้ายกว่าเดิม ในขณะที่ Shuuya พยายามหยุดยั้งการกระทำของรัฐบาลและช่วยเด็ก ๆ เหล่านี้ เขาต้องเผชิญกับอุปสรรคและความท้าทายในการต่อสู้กับทั้งรัฐบาลและความโหดร้ายของเกมที่พวกเขาต้องเผชิญ
