ในภาพยนตร์นี้, Ben Tennyson (ให้เสียงโดย Tara Strong) ต้องเผชิญหน้ากับศัตรูที่ทรงพลังที่สุดในชีวิตของเขา Vilgax ซึ่งเป็นผู้ที่ต้องการใช้พลังของ Omnitrix เพื่อครองจักรวาล
เมื่อ Vilgax วางแผนที่จะทำลาย Ben และโลก เขาจึงต้องใช้พลังที่เขามีเพื่อหยุดยั้งการคุกคามนี้ แต่การต่อสู้ไม่ง่ายอย่างที่คิด เพราะ Ben ต้องเผชิญกับอุปสรรคมากมายและต้องเรียนรู้เกี่ยวกับความรับผิดชอบและการทำงานร่วมกับเพื่อน ๆ ของเขา
