ภาพยนตร์เล่าเรื่องราวเกี่ยวกับ BoBoiBoy (รับบทเสียงโดย Nizam Razak), เด็กชายที่มีพลังพิเศษในการควบคุมธาตุต่างๆ ที่ต้องต่อสู้กับ Pato (ศัตรูหลัก) ซึ่งมาพร้อมกับความตั้งใจที่จะขโมยพลังของเขา BoBoiBoy และเพื่อนๆ ต้องร่วมกันเพื่อปกป้องโลกจากภัยคุกคามที่กำลังจะมาถึง
ในระหว่างการผจญภัย BoBoiBoy ต้องเผชิญกับอุปสรรคต่างๆ ที่ทดสอบความกล้าหาญและความเป็นทีมของเขา พร้อมกับการพัฒนาความสามารถของตัวเองและการเรียนรู้ถึงความสำคัญของมิตรภาพ
