เรื่องราวเริ่มต้นเมื่อ โคนัน (ชินอิจิ คุโด) และกลุ่มเพื่อนของเขาเดินทางไปยังงานนิทรรศการที่จัดขึ้นเกี่ยวกับนัยน์ตาที่มีชื่อเสียงและมีประวัติศาสตร์มากมาย แต่ในระหว่างงานมีเหตุการณ์ฆาตกรรมเกิดขึ้นซึ่งเกี่ยวข้องกับนัยน์ตาอันลึกลับที่มีพลังในการมองเห็นความจริง
การฆาตกรรมทำให้โคนันต้องร่วมมือกับ ฮิโรชิ และ รัน ในการสืบสวนเพื่อค้นหาความจริงเกี่ยวกับการฆาตกรรมที่เกิดขึ้น พวกเขาต้องเผชิญกับอันตรายจากฆาตกรที่มีอุบายซับซ้อน และระหว่างการสืบสวนยังต้องค้นหาความเชื่อมโยงที่น่าสงสัยเกี่ยวกับอดีตของผู้เสียชีวิต
