ใน Season 2, Leonardo (รับบทโดย Tom Riley) ยังคงต่อสู้เพื่อค้นหาความจริงเกี่ยวกับตัวเองและอาณาจักรที่เขาอาศัยอยู่ หลังจากเหตุการณ์ใน Season 1 ที่ทำให้เขาได้เรียนรู้เกี่ยวกับความลับของ Nefilim (เผ่าพันธุ์ที่มีพลังเหนือธรรมชาติ) และการต่อสู้กับ Pope Sixtus IV (รับบทโดย James Faulkner)
Leonardo ต้องเผชิญกับการเมืองที่ซับซ้อนในยุคฟื้นฟูศิลปวิทยา เขาพยายามที่จะหยุดยั้งแผนการชั่วร้ายที่อาจนำไปสู่สงครามและความวุ่นวาย ในขณะที่เขาค้นหาความจริงเกี่ยวกับพ่อของเขาและการค้นพบความลับที่ซ่อนอยู่ในอดีต
เรื่องราวยังมีตัวละครสำคัญอื่น ๆ เช่น Lorenzo de’ Medici (รับบทโดย Eros Vlahos) และ Lucrezia Donati (รับบทโดย Laura Haddock) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาความสัมพันธ์และการต่อสู้เพื่อความยุติธรรมในสังคม
