เรื่องราวเกิดขึ้นในอนาคตหลังจากเหตุการณ์ในภาคก่อน ประมาณ 10 ปีหลังจากที่ไวรัสที่สร้างขึ้นในภาคก่อนทำให้มนุษย์ส่วนใหญ่สูญพันธุ์ ชนเผ่าวานรที่นำโดย Caesar (รับบทโดย Andy Serkis) ได้พัฒนาไปสู่สังคมที่มีความซับซ้อนและความเป็นระเบียบ
เมื่อมนุษย์กลุ่มหนึ่งที่รอดชีวิตจากไวรัสพยายามกลับมาใช้ชีวิตในซานฟรานซิสโกและต้องการพลังงานจากเขื่อนที่อยู่ในพื้นที่ที่วานรอาศัยอยู่ ทั้งสองฝ่ายจึงต้องเผชิญหน้ากันในความขัดแย้งที่รุนแรง ซึ่งทั้งสองฝ่ายมีความตั้งใจในการเอาตัวรอดและปกป้องครอบครัว
