เรื่องราวเริ่มต้นที่การทดลองนิวเคลียร์ในทะเลแปซิฟิก ซึ่งก่อให้เกิดการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรม ทำให้เกิดการสร้าง Godzilla สัตว์ประหลาดขนาดมหึมาที่ปรากฏขึ้นในเมือง นิวยอร์ก เพื่อทำลายล้างทุกสิ่งทุกอย่างที่ขวางหน้า
Nick Tatopoulos (รับบทโดย Matthew Broderick), นักวิทยาศาสตร์ที่ทำงานเกี่ยวกับสัตว์ประหลาด ได้รับมอบหมายให้ช่วยรัฐบาลในการจัดการกับ Godzilla เขาและทีมงานของเขาต้องพยายามหาวิธีหยุดยั้งการทำลายล้างของสัตว์ประหลาดนี้ในขณะที่ต้องเผชิญหน้ากับความโ chaos ที่เกิดขึ้นในเมือง
ในขณะเดียวกัน, Godzilla เริ่มสร้างรังในนิวยอร์กและวางไข่ ซึ่งนำไปสู่การต่อสู้ที่ดุเดือดระหว่างสัตว์ประหลาดและกองทัพ