เรื่องราวเกิดขึ้นหลังจากเหตุการณ์ในภาพยนตร์ Godzilla ก่อนหน้านี้ เมื่อ Godzilla กลับมาอีกครั้งและสร้างความวุ่นวายในเมืองญี่ปุ่น ขณะที่นักวิทยาศาสตร์กำลังทำงานกับ Genetic Engineering เพื่อสร้างสิ่งมีชีวิตใหม่เพื่อช่วยในการรักษาโลก พวกเขาได้ทดลองใช้ DNA ของ Godzilla ร่วมกับ DNA ของ Rose ซึ่งนำไปสู่การสร้าง Biollante สัตว์ประหลาดที่มีรูปร่างคล้ายต้นไม้ แต่มีพลังมหาศาล
Biollante มีความสามารถในการเติบโตและฟื้นฟูตัวเอง ทำให้มันกลายเป็นภัยคุกคามที่อาจเกินกว่าที่ Godzilla จะสามารถจัดการได้ เมื่อ Godzilla และ Biollante ประสบกันในสนามรบ ความตื่นเต้นและการต่อสู้ระหว่างพวกเขาเป็นจุดเด่นที่ทำให้ภาพยนตร์นี้น่าติดตาม
