เรื่องราวติดตาม Kubo (ให้เสียงโดย Art Parkinson), เด็กชายที่อาศัยอยู่ในหมู่บ้านเล็ก ๆ ในประเทศญี่ปุ่น Kubo มีความสามารถในการเล่าเรื่องและเล่นพิณที่มีมนต์ขลัง ซึ่งทำให้เขาสามารถสร้างภาพและตัวละครจากการเล่าเรื่องของเขา
ชีวิตของ Kubo เปลี่ยนไปเมื่อเขาเผชิญกับการกลับมาของศัตรูในอดีต ซึ่งเป็นสมาชิกของครอบครัวที่มีพลังเหนือธรรมชาติ เขาจึงต้องออกเดินทางเพื่อค้นหาชุดเกราะที่มีมนต์ขลังเพื่อปกป้องตัวเองและค้นหาความจริงเกี่ยวกับอดีตของครอบครัว
ในระหว่างการเดินทาง Kubo ได้พบกับ Monkey (ให้เสียงโดย Charlize Theron) และ Beetle (ให้เสียงโดย Matthew McConaughey), ผู้ช่วยที่ช่วยเขาในการต่อสู้กับอุปสรรคและความท้าทายที่ต้องเผชิญ Kubo ต้องเรียนรู้เกี่ยวกับความกล้าหาญและการรับมือกับความสูญเสียในขณะที่เขาตามหาชุดเกราะเพื่อปกป้องคนที่เขารัก
