เรื่องราวเริ่มต้นเมื่อ อีธาน ฮันท์ (รับบทโดย Tom Cruise) และทีม IMF ของเขาต้องต่อสู้กับองค์กรลับที่มีชื่อว่า “ซินดิเคท” ซึ่งเป็นกลุ่มที่มีการฝึกฝนและดำเนินการอย่างเป็นระบบ เพื่อทำลาย IMF และสร้างความวุ่นวายทั่วโลก
หลังจากที่ IMF ถูกปิดตัวลง อีธานต้องทำงานคนเดียวเพื่อเปิดเผยความลับของซินดิเคทและหยุดยั้งแผนการชั่วร้ายของพวกเขา พร้อมกับการช่วยเหลือจากเพื่อนร่วมงานเก่าและสมาชิกใหม่อย่าง ลูเธอร์ สติเกล (รับบทโดย Ving Rhames), เบนจี้ ดัน (รับบทโดย Simon Pegg), และ อิลซ่า ฟอส (รับบทโดย Rebecca Ferguson)
