ใน “Fallout,” อีธาน ฮันท์ (รับบทโดย Tom Cruise) และทีม IMF ของเขาต้องจัดการกับผลลัพธ์ที่เกิดจากการส่งมอบหัวรบนิวเคลียร์ไปยังกลุ่มผู้ก่อการร้าย หลังจากที่ภารกิจครั้งก่อนดำเนินไปไม่เป็นไปตามแผน อีธานต้องเผชิญกับการตัดสินใจที่ยากลำบากและผลที่ตามมาจากการกระทำของเขา
การดำเนินเรื่องเริ่มต้นขึ้นเมื่อพวกเขาได้ทำข้อตกลงกับกลุ่มที่มีชื่อว่า “ซินดิเคท” เพื่อพยายามหยุดการสร้างอาวุธนิวเคลียร์ ทีม IMF ต้องร่วมมือกับ อัลเลน ฮันลีย์ (รับบทโดย Alec Baldwin) และ ซูเปอร์มิน (รับบทโดย Henry Cavill) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการต่อสู้กับศัตรูที่มีอำนาจ
