เรื่องราวเริ่มต้นเมื่อ Hanzo Hasashi (Scorpion) (ให้เสียงพากย์โดย Joel McHale) ถูกฆ่าตายโดย Sub-Zero (ให้เสียงพากย์โดย Steve Blum) และครอบครัวของเขาถูกทำลาย การตายของเขาไม่สิ้นสุดในโลกนี้ แต่เขาถูกส่งไปยัง Netherrealm ซึ่งเป็นโลกของวิญญาณและความตาย
Scorpion ต้องต่อสู้กับอำนาจที่มืดมิดและมองหาความยุติธรรมให้กับครอบครัวของเขา ขณะเดียวกัน เขาต้องเข้าร่วม Mortal Kombat, การต่อสู้เพื่อเอาชีวิตรอดที่มีผู้ต่อสู้จากทั่วโลก รวมถึงตัวละครอื่น ๆ ที่เป็นที่รู้จักในแฟรนไชส์ เช่น Liu Kang, Raiden, Sonya Blade, และ Johnny Cage
