เรื่องราวเริ่มต้นเมื่อ Twilight Sparkle และเพื่อน ๆ ของเธอใน Ponyville ต้องเผชิญกับภัยคุกคามจากผู้รุกรานที่มีชื่อว่า Tempest Shadow (รับบทโดย Emily Blunt) ที่ต้องการยึดครอง Equestria โดยการขโมยพลังของโพนี่
เมื่ออาณาจักรของพวกเธอถูกทำลายและพวกเขาต้องหนีไปยังสถานที่ใหม่ ๆ Twilight Sparkle และเพื่อน ๆ ต้องร่วมมือกันเพื่อหยุดยั้ง Tempest Shadow และช่วยกันฟื้นฟูความสงบสุข ในระหว่างการเดินทาง พวกเขายังได้พบกับตัวละครใหม่ ๆ และเรียนรู้เกี่ยวกับความสำคัญของมิตรภาพและความเชื่อมั่นในตัวเอง
