ภาพยนตร์เริ่มต้นด้วย Alice (รับบทโดย Milla Jovovich), ผู้หญิงที่มีทักษะในการต่อสู้และต่อสู้กับสิ่งมีชีวิตที่ถูกสร้างขึ้นจากไวรัส T-virus ของ Umbrella Corporation หลังจากเหตุการณ์ในภาคก่อนหน้านี้, Alice ถูกจับตัวโดย Umbrella และถูกนำไปยังสถานที่ซึ่งเป็นห้องทดลองใต้ดินที่เต็มไปด้วยอันตราย
ในห้องทดลองนั้น, Alice พบกับการทดลองที่เกี่ยวข้องกับผู้รอดชีวิตจากทั่วโลก รวมถึงการต่อสู้กับศัตรูที่ถูกสร้างขึ้นจากไวรัสและสัตว์ประหลาดต่าง ๆ ขณะเดียวกัน, เธอต้องหาวิธีหล escape และต่อสู้เพื่อช่วยเหลือเพื่อนร่วมทีม รวมถึงการค้นหาความจริงเกี่ยวกับ Umbrella
