เรื่องราวเริ่มต้นเมื่อมีการค้นพบสัตว์ประหลาดที่มีลักษณะคล้ายก็อดซิลล่าขึ้นมาจากมหาสมุทร ทำให้เกิดความสับสนและความกลัวในญี่ปุ่น ในขณะที่รัฐบาลญี่ปุ่นพยายามหาทางจัดการกับสถานการณ์ที่เกิดขึ้น กลุ่มนักวิทยาศาสตร์และเจ้าหน้าที่รัฐต้องทำงานร่วมกันเพื่อวิเคราะห์และต่อสู้กับภัยคุกคามที่เพิ่มขึ้นจากก็อดซิลล่า ซึ่งมีการพัฒนาและเปลี่ยนแปลงรูปแบบอย่างรวดเร็ว