เรื่องราวใน Shin Ultraman จะนำเสนอการกลับมาของ อุลตร้าแมน ซึ่งเป็นฮีโร่จากนอกโลกที่มาปกป้องโลกจากภัยคุกคามของ สัตว์ประหลาด (Kaiju) และผู้ที่มาจากต่างดาวในยุคสมัยใหม่ การปรากฏตัวของอุลตร้าแมนทำให้เกิดความหวังและความกังวลในสังคมมนุษย์
ในภาพยนตร์นี้ อุลตร้าแมนจะต้องเผชิญหน้ากับศัตรูที่เป็นสัตว์ประหลาดที่เข้ามาคุกคามโลก และในขณะเดียวกัน เรื่องราวยังสำรวจถึงความสัมพันธ์ระหว่างอุลตร้าแมนและมนุษย์ รวมถึงการต่อสู้เพื่อปกป้องโลก
