เนื้อเรื่องของภาพยนตร์เริ่มต้นขึ้นเมื่อ สเมิร์ฟกลุ่มหนึ่ง ได้ค้นพบแผนที่ลึกลับที่นำพาพวกเขาไปสู่ หมู่บ้านที่สาบสูญ ซึ่งมีสเมิร์ฟหญิงที่พวกเขาไม่เคยพบมาก่อน นำโดย Smurfette (ให้เสียงโดย Demi Lovato), Brainy (ให้เสียงโดย Danny Pudi), และ Hefty (ให้เสียงโดย Joe Manganiello), พวกเขาออกเดินทางเพื่อค้นหาหมู่บ้านนี้และไขความลับที่ซ่อนอยู่
