เรื่องราวเริ่มต้นที่ Sonic (เสียงพากย์โดย Ben Schwartz), เม่นสีน้ำเงินที่มีความเร็วเหนือธรรมชาติ เขาใช้ชีวิตอย่างโดดเดี่ยวในโลกมนุษย์และต้องหนีจากเหล่าศัตรูที่ต้องการจับตัวเขาไปทดลองเพื่อใช้พลังของเขา
เมื่อ Sonic ได้พบกับ Tom Wachowski (รับบทโดย James Marsden), นายอำเภอในเมืองเล็ก ๆ ที่ช่วยเขา Sonic ต้องร่วมมือกับ Tom เพื่อหยุดยั้ง Dr. Robotnik (รับบทโดย Jim Carrey), วิศวกรที่ต้องการจับ Sonic เพื่อใช้พลังของเขาในการควบคุมโลก
