เรื่องราวในภาคนี้เกิดขึ้นในอนาคตที่ไกลโพ้นเมื่อมนุษย์ต้องเผชิญกับการโจมตีจาก Arachnids หรือแมงมุมอวกาศที่มีพลังทำลายล้างสูง หลังจากที่ดาวเคราะห์ต่าง ๆ ถูกโจมตีโดยแมงมุมที่ดุร้าย มนุษย์ต้องรวมพลังกันเพื่อเอาชนะภัยคุกคามนี้
ใน Starship Troopers: Invasion, กลุ่มทหารที่รู้จักกันในชื่อ Mobile Infantry ได้รับมอบหมายให้ทำภารกิจในการตรวจสอบการโจมตีที่เกิดขึ้นบนสถานีอวกาศ Fortress และค้นหาความจริงเกี่ยวกับการโจมตีที่เกิดขึ้นในอดีต
เรื่องราวจะเน้นไปที่การต่อสู้ระหว่างทหารและแมงมุมอวกาศ การเปิดเผยความลับเกี่ยวกับการโจมตี และความสำคัญของการทำงานร่วมกันเพื่อเอาชนะศัตรูที่มีพลังมหาศาล
