เรื่องราวเกิดขึ้นในอนาคตหลังจากการต่อสู้ที่เกิดขึ้นในภาคก่อนหน้านี้ โดยโลกได้ตกอยู่ภายใต้การควบคุมของ Skynet ซึ่งเป็นระบบปฏิบัติการที่มุ่งหมายจะกำจัดมนุษยชาติ
John Connor ซึ่งเป็นผู้นำของกลุ่มต่อต้านมนุษย์ต้องต่อสู้เพื่อความอยู่รอดของมนุษย์ในสงครามกับเครื่องจักร เขาค้นพบว่า Marcus Wright, ชายผู้ที่ถูกตายและถูกคืนชีพเป็นเครื่องจักร, มีความเกี่ยวข้องกับความพยายามที่จะปกป้องอนาคตของมนุษย์
Marcus มีภารกิจในการค้นหาความจริงเกี่ยวกับตัวเองและการมีส่วนร่วมในสงคราม ในขณะที่ Connor ต้องจัดการกับการปรากฏตัวของเครื่องจักรที่พยายามจะทำลายความหวังของมนุษย์
