เรื่องราวเกิดขึ้นในเมือง Ninjago ที่ซึ่งกลุ่มนินจาได้ทำการต่อสู้กับ ลอร์ดเบนเจน (Lord Garmadon) ที่เป็นวายร้ายและพ่อของ ลอยด์ (Lloyd) หัวหน้านินจา โดยที่ลอยด์ต้องจัดการกับความขัดแย้งระหว่างการเป็นนินจาและความสัมพันธ์กับพ่อของเขาที่ไม่ค่อยดีนัก
เมื่อลอร์ดเบนเจนกลับมาทำลายเมืองอีกครั้ง ลอยด์และเพื่อนนินจาของเขาต้องร่วมมือกันเพื่อปกป้องเมืองและหยุดพ่อของเขาจากการทำลายล้าง นอกจากการต่อสู้กับศัตรูแล้ว ลอยด์ยังต้องค้นหาตัวตนและเข้าใจความรักระหว่างเขากับพ่อ
