เรื่องราวของ “The Matrix” เริ่มต้นขึ้นในโลกที่ดูเหมือนจะเป็นโลกปกติ แต่ในความเป็นจริงแล้วมันเป็นโลกที่ถูกควบคุมโดย Machines (เครื่องจักร) ที่สร้าง Matrix ขึ้นมาเพื่อใช้มนุษย์เป็นแหล่งพลังงาน ขณะที่มนุษย์ถูกทำให้หลับใหลใน Pods และไม่รู้ตัวว่าพวกเขากำลังถูกควบคุมอยู่
Thomas Anderson (รับบทโดย Keanu Reeves), นักโปรแกรมเมอร์ที่ทำงานในบริษัทซอฟต์แวร์ โดยในเวลากลางคืนเขาเป็นแฮ็กเกอร์ที่รู้จักในชื่อว่า Neo เขาเริ่มมีคำถามเกี่ยวกับความเป็นจริงและความจริงที่อยู่เบื้องหลังโลกที่เขาอาศัยอยู่
Neo ถูกนำไปพบกับ Morpheus (รับบทโดย Laurence Fishburne), ผู้นำของกลุ่มมนุษย์ที่ต่อสู้กับ Machines และเชื่อว่า Neo คือ The One ผู้ที่จะสามารถปลดปล่อยมนุษยชาติจากการควบคุมของ Machines ได้ Morpheus และทีมของเขา รวมถึง Trinity (รับบทโดย Carrie-Anne Moss), ช่วย Neo ในการค้นหาความจริงและพยายามหยุดยั้ง Machines
