เรื่องราวยังคงติดตาม Pi (เสียงพากย์โดย Andy McDowell), ปลาเล็กที่มีความกล้าหาญและมุ่งมั่นในการทำความดีในโลกใต้ทะเล หลังจากที่เขาได้พิสูจน์ตัวเองในภาคแรก ตอนนี้ Pi กลับมาพร้อมกับความท้าทายใหม่ ๆ
ในภาคนี้ Pi และเพื่อน ๆ ต้องเผชิญกับภัยคุกคามใหม่จาก Tornado, ปลาใหญ่ที่มีอำนาจและต้องการทำลายความสงบสุขในทะเล การผจญภัยในครั้งนี้จะทำให้ Pi ต้องใช้ความกล้าหาญและทักษะการว่ายน้ำของเขาเพื่อช่วยเหลือเพื่อน ๆ และปกป้องบ้านของพวกเขา
