เรื่องราวเกิดขึ้นหลังจากเหตุการณ์ใน The Avengers เมื่อ Thor (แสดงโดย Chris Hemsworth) ต้องกลับไปยังโลกของเขา แอสการ์ด เพื่อต่อสู้กับภัยคุกคามจาก โลกาทมิฬ (Dark Elves) ที่นำโดย Malekith (แสดงโดย Christopher Eccleston) ซึ่งมีแผนการจะใช้ Aether เพื่อครองจักรวาลและคืนชีพให้กับโลกาทมิฬ
ในระหว่างการต่อสู้ Thor ได้รับการช่วยเหลือจาก Jane Foster (แสดงโดย Natalie Portman) ซึ่งได้พบกับ Aether ในโลกมนุษย์และทำให้เธอเป็นเป้าหมายของ Malekith การต่อสู้ระหว่าง Thor และ Malekith จึงเกิดขึ้นเพื่อปกป้องทั้งโลกและคนที่เขารัก
