เรื่องราวเกิดขึ้นหลังจากเหตุการณ์ในซีซั่นที่สาม เมื่อ Optimus Prime (ให้เสียงโดย Peter Cullen) ต่อสู้กับภัยคุกคามจาก Megatron (ให้เสียงโดย Frank Welker) และเพื่อนร่วมทีมของเขาต้องเผชิญหน้ากับความท้าทายใหม่ในสงครามระหว่าง Autobots และ Decepticons
ในขณะที่โลกอยู่ในความไม่สงบ Megatron ได้กลับมาพร้อมกับพลังใหม่และแผนการที่จะฟื้นคืนชีพ Predacons, กลุ่ม Cybertronian ที่มีพลังและสามารถทำลายโลกได้ Optimus Prime และ Autobots ต้องร่วมมือกันเพื่อหยุดยั้งแผนการนี้ ก่อนที่ทุกอย่างจะสายเกินไป